Paris 2019

La réunion annuelle du réseau ModStatSAP, à laquelle est associé le CATI IMOTEP (Information, Modèles et Traitement des données en Epidémiologie et dynamique de Populations), aura lieu à PARIS le mardi 12 mars 2019.

 

Lieu: Institut des Systèmes Complexes, 113 rue Nationale, 75013 Paris, joignable par le métro Nationale ligne 6 (direct depuis la Gare Montparnasse) ou métro Olympiades ligne 14 (direct depuis la Gare de Lyon), ensuite il y a environ 5-10 min de marche

 

Horaires: 9h30 - 17h30

 

Inscription et proposition d'exposé:

Inscription gratuite 
Repas offert aux participants inscrits
Possibilités de financement des trajets (demande à faire dans le formulaire d'inscription)

Dans le cadre de l'association entre le réseau ModStatSAP et le CATI IMOTEP pour l'organisation de cette journée de séminaires, la proposition de présentations mettant en avant l'ingénierie en lien avec les thématiques du CATI IMOTEP est encouragée.

 

Dates limites d'inscription :
- le 15 février pour proposer une présentation ou demander le financement des trajets
- le 4 mars pour bénéficier du repas de midi offert

 

Orateurs invités

Vincent Bansaye (Ecole Polyechnique, CMAP)
Réponses fonctionnelles stochastiques et modèles multi échelles en dynamique des populations
Timothée Vergne (Ecole Nationale Vétérinaire Toulouse, EPIDEC)
Unravelling the spatial pattern of the chikungunya virus emergence in the Martinique Island: implications for optimising intervention strategies for vector-borne diseases

 

Quelques mots-clés du réseau ModStatSAP: modèles, probabilités, spatial, temporel, réseaux, épidémiologie, biodiversité, évolution, prédictions, ingénierie logicielle et matérielle

 


Programme (Résumés des présentations)

 

Accueil : 09h15 - 09h30 

Session 1 : Modélisation et stratégies de lutte

09h30 – 09h50 Maxime GARNAULT, INRA MaIAGE & BIOGER Jouy-en-Josas & Grignon
L’utilisation de fongicides à l’échelle régionale : un déterminant majeur de la diversité spatio-temporelle des dynamiques des résistances aux fongicides observées chez Zymoseptoria tritici en France

09h50 – 10h10 Gaël THEBAUD, INRA BGPI Montpellier
De l’inférence de la fonction de dispersion des pucerons à l’optimisation conjointe de la gestion de la sharka et de l’allocation de variétés résistantes

10h10 – 10h30 César MARTINEZ, INRA CEE-M Montpellier
Interactions stratégiques et contrôle optimal d’une épidémie touchant une culture pluriannuelle

10h30 – 10h50 Thibaut MOREL-JOURNEL, INRA BIOEPAR Nantes
Un algorithme de réallocation de mouvements appliqué à la propagation d'épidémies chez les bovins

10h50 – 11h05 Pause

11h05-11h50 Exposé invité : Timothée VERGNE, Ecole Nationale Vétérinaire Toulouse EPIDEC
Unravelling the spatial pattern of the chikungunya virus emergence in the Martinique Island: implications for optimising intervention strategies for vector-borne diseases

Session 2 : Epidémiosurveillance

11h50 – 12h05 Lucie MICHEL, INRA BioSP Avignon
Présentation de la Plateforme d’Epidémiosurveillance en Santé Végétale : constitution d'une équipe opérationnelle tournée vers les données

12h05 – 12h20 Sylvain FALALA, INRA-CIRAD Astre Montpellier
PADI-web : un système de veille sanitaire pour analyser l’émergence et la propagation de maladies animales

12h20 – 13h40 Repas

Session 3 : Modélisation stochastique et statistique

13h40 – 14h25 Exposé invité : Vincent BANSAYE, Ecole Polytechnique CMAP Palaiseau
Réponses fonctionnelles stochastiques et modèles multi échelles en dynamique des populations

14h25 – 14h45 Morgane SALINES, Anses UEPEB Ploufragan
Designing a stochastic individual-based multi-pathogen model to understand hepatitis E virus (HEV) dynamics in a farrow-to-finish pig farm

14h45 – 15h05 Gildas MAZO, INRA MaIAGE Jouy-en-Josas
Optimal balance between repetitions and explorations in sensitivity analysis for stochastic models

15h05 – 15h20 Pause

15h20 – 15h40 Maryam ALAMIL, INRA BioSP Avignon
A statistical learning approach to infer transmissions of infectious diseases from deep sequencing data

15h40 – 16h00 David Abrial, INRA EPIA Theix
Une approche bayésienne de l'étude des populations de bactéries pathogènes pour données méta-génomiques

Session 4 : Modélisation et développements informatiques

16h00– 16h15 Jocelyn DE GOER, INRA EPIA Theix
PSH, une fonction de hachage perceptuel permettant l’indexation et la comparaison des séquences ADN

16h15 – 16h30 Sébastien PICAULT, INRA BIOEPAR Nantes
Comparer métaphylaxie et détection précoce dans le traitement des bronchopneummonies infectieuses des jeunes bovins : une modélisation flexible et modulaire

16h30 – 16h45 Emily WALKER et Olivier BONNEFON, INRA BioSP Avignon
Environnement Méca-Stat et démonstrations

16h45 – 17h00 Thierry HOCH, BIOEPAR Nantes
Le CATI IMOTEP : un collectif pour des projets d'ingénierie en épidémiologie et dynamique des populations

17h00 Discussion sur les interactions entre le réseau ModStatSAP et le CATI IMOTEP

 

Financement:

  • Dpt. Santé des Plantes et Environnement, INRA
  • Dpt. Mathématiques et Informatique Appliquées, INRA
  • Dpt. Santé Animale, INRA